Sekolah Tinggi Teologi Injili Indonesia Pontianak (STTII Pontianak) berdiri pada tahun 1986 di Kota Pontianak, Kalimantan Barat, di bawah naungan Yayasan Iman Indonesia (YII). Lembaga ini lahir melalui kerjasama dengan Christian Nationals' Evangelism Commission (CNEC) Singapura sebagai jawaban atas kebutuhan tenaga pelayan gereja yang terlatih di wilayah Kalimantan Barat.

Diprakarsai oleh Pdt. Edy Prabowo, S.Th, Pdt. Salomi Imang, S.Th, Wilyulishen Siregar, S.Th., dan Rev. Raymond Ho, M.Div., pendirian ini merupakan langkah strategis dalam realisasi Visi 111 oleh Pdt. Dr. Chris Marantika.

Awalnya dikenal sebagai Akademi Teologi Injili Indonesia (ATII), lembaga ini berubah menjadi STTII Pontianak pada tahun 2003 seiring dengan peningkatan kapasitas dan statusnya. Dengan akreditasi BAIK oleh BAN-PT, STTII Pontianak terus berkomitmen mencetak hamba-hamba Tuhan yang berpengetahuan, berkarakter Kristus, dan siap melayani gereja serta masyarakat.